1961年

1月2日，黄骅县决定，从南大港农场划出羊三木、三虎庄、刘皮庄子、王庄子、辛庄等五个村，单建羊三木农场。1月14日，南大港农场由5个管理区改成7个分场。

4月至5月初，解散了各生产队的公共食堂。

10月9日，省政府决定，南大港农场归沧州地区行署领导，撤销南大港人民公社名称。

1962年

3月10日，南大港农场划出周青庄、下三堡、南北刘三庄、刘家场、大王庄、小王庄、官地、吴家堡、新立村等10个村，单建周青庄公社。

6月22日，南大港农场由地区属划归省农垦局领导。

1963年

7月，河北南部发生特大洪水，严重威胁天津和运河西各县。南大港农场组织4千名劳力泄洪，在南大港东北部（三岔河口）和东部泄洪闸南侧扒开港堤泄洪。并从港堤到海边筑长1200余米、宽6米、高3米的大坝保护渔村。抽调80名精壮劳力、渔船40只，赴交河县洼里王抢险救援。

8月27日，排洪基本结束，组织3000余人、300多只船载三岔河口复堤蓄水，经三昼夜苦干，堵住水深3米半、宽183米浪大流急的泄洪口。保证了大港正常蓄水。

1964年

1月9日，场党委部署开展粗线条的四清工作。召开生活会，进行“洗手洗澡”、展开面对面、背对背“搓澡”帮助。揭发经济不清的严重问题，进行内查外调工作。

1965年

6月至8月，持续两个月大旱，水库水源不足，水稻秧苗部分干死。农场动员9100余人抗旱，启动扬水站，投入水泵31台、拖拉机20台、大小机器71台，修整灌水面积2800多亩、挖用水沟渠动土28万立方米，保住了44000亩水稻。

10月16日，沧州地委派驻72人的四清工作分团进驻南大港农场，铺开四清运动。10月19日，工作分团召开动员大会，内容是：清经济、清政治、清组织、清思想。运动重点是：整那些走资本主义道路的当权派。

1966年

5月4日，由于大港油田对南大港水库区进行石油开发，国务院决定南大港水库停止蓄水。全场由水田改种旱田。

9月，大破“四旧”、大立“四新”、横扫一切牛鬼蛇神的运动掀起高潮。500多名红卫兵和全场干部群众写出大字报2万余张、砸烂佛龛393个、砸碎祖签、香炉、佛像3200件。各村交出家谱155本，连同一部分黄色书刊画像等全部烧毁。红卫兵平掉了村西南的刘氏大祖坟。

1967年

1月下旬，农场相继成立大型造反派组织“只争朝夕联合司令部”（简称“只争朝夕”）、“一·二〇联合司令部”（简称“联总”）。

9月24日，“只争朝夕”和“联总”两派群众组织实行了大联合。在军分区和黄骅县人民武装部指导下，举行四次毛泽东思想学习班。

1968年

7月1日，南大港农场革命委员会成立，农场召开万人大会庆祝。（革委会成立后，先后进行整党、审干、吐故纳新、清队、斗批改、一打三反等运动，

 1969年

12月30日，响应毛主席“备战备荒为人民”的指示，建立民兵独立营。各生产队开始挖地道。到1970年6月，共挖地道4800多米。在扣村修建永久性地下指挥部1座（350平方米）、地下医院240平方米，可容纳40张床位。培养战备卫生员65名，训练战场救护员350名。

1970年

4月，兴建盐酸厂、糖酒厂。

11月16日，兴建炼油厂、石油化工实验厂，成立基建队、机井队、供电所。当年，农场工业起步。